На побережье озера Неро расположен архитектурный ансамбль бывшего архиерейского дома, известного как Ростовский кремль. Он был сформирован в период с 1670 по 1680-е годы в результате строительной деятельности митрополита Иона (III) Сысоевича. Теперь на его обширной территории находится государственный музей-заповедник, созданный по инициативе краеведов Ивана Шлякова и Андрея Титова, ярославского губернатора Владимира Левшина, ростовских купцов и представителей из столичного археологического общества в 1883 году.
В период строительства кремля Ростов уже не имел оборонного значения, но тем не менее сооружение было возведено в традициях русской военной архитектуры допетровской эпохи. Архитектурный ансамбль включает 5 церквей (Григория Богослова, Спаса на Сенях, Одигитрии, Иоана Богослова, надвратную в честь Воскресения), Успенский собор и его звонницу, Судный приказ, Святые ворота, Самуилов корпус, Красную палату, "Дом на погребах", Башню кремля, Белую палату.
Церковь Спаса на Сенях, построенная в 1675 году, служила домовым храмом ростовских архиереев. Внутренний интерьер с аркадой, расположенной на позолоченных столбах, не повторяется еще где-либо и потому является единственным в своем роде. Росписью стен занимались ярославские мастера и поп Тимофей. Через три столетия живопись была отреставрирована и восстановлена в своем изначальном виде. Лучшей композицией настенной росписи считается "Страшный суд", находящаяся в западной части помещения. Картина, изображающая сцены из христианского сюжета, легко воспринимается по частям и в целом благодаря гармоничному распределению цветовых элементов, оттенков, их плавным ипереходами.
Успенский собор и его звонница расположены на площадке с невысокой кирпичной стеной, где проходом служат "Святые ворота". Пятиглавое сооружение имеет множество декоративных деталей, среди которых выделяются горизонтальные филенки, колончатые пояса. По своим внешним очертаниям храм похож на Московский Успенский Собор и связан с традициями Владимиро-Суздальского зодчества. Окна в виде бойниц расположены в два яруса, между которыми проходит аркатурный пояс. Такие архитектурные особенности придают массивному сооружению элементы изящества и необычной для него легкости. В интерьерах собора сохранился старинный иконостас, датируемый 1740-ми годами. Выполненный в стиле барокко он аналогичен тому, который находится в Горицком монастыре Переславля-Залесского.
Церковь Одигитрии, построенная в 1693 году, выполнена в стиле московского барокко. Расположенная в северо-западном углу кремля, она была возведена в то время, когда Митрополичий двор уже окружали стены. Церковь своей архитектурой отличается от других сооружений ансамбля, тем, что в ней отсутствуют галереи, а по периметру второго этажа расположены открытые балконы. Стены фасада покрыты треугольным орнаментом, издали оздающим эффект рельефа. В церкви лишь второй ее этаж использовался по назначению. Своды и стены внутренних помещений имеют 20 лепных картушей. Теперь внутри храма находится музейная экспозиция.