Западный Тянь-Шань — часть обширной горной системы, одной из высочайших в Средней Азии. К нему относится ряд разнонаправленных хребтов на территории Казахстана, Узбекистана, Киргизии и Таджикистана. В Кыргызстане выделяются хребты Таласского Ала-Тоо, Чаткальский и Атонайский. В пределах двух последних раскинулись три государственных заповедника, включённых в список объектов Всемирного наследия как особенно ценные районы природных сообществ.
Сары-Челикский заповедник
Этот государственный биосферный заповедник — старейшая природоохранная территория Западного Тянь-Шаня в Киргизии. Она раскинулась на 238 квадратных километрах Чаткальского и Актонайского хребтов в границах Аксыйского района Джалал-Абадской области. Офис заповедника находится в посёлке Аркит.
Сары-Челекский заповедник основан в 1959 году и имел площадь 20,8 тысяч гектар. Нынешние размеры установились за счёт присоединения угодий Афлатунского лесхоза. В 1979 заповедник вошёл в список биосферных заповедников ЮНЕСКО.
Северной, западной и восточной границей заповедника служит Чаткальский хребет, а на юге он подступает к Ферганской долине. Благодаря этому на его территории сформировался свой климатический режим с мягкой и малоснежной зимой.
В Сары-Челикском заповеднике 40% площади укрыты лесами. Встречаются горные луга, открытые скалы, ледники, болота. Очень много рек. Основной считается Кожо-Ата, разделяющая заповедник на восточную и западную части.
Жемчужиной заповедника считается высокогорное озеро Сары-Челек («жёлтая чаша»). Оно сформировалось 10 тысяч лет назад в результате обвала. Озеро вытянулось на 7,5 километров с севера на юг, а самое широкое место — 2,5 километров. Глубина достигает 98 метров. Кроме Сары-Челек на территории заповедника есть 6 малых озёр.
Падышатинский заповедник
Второй по величине заповедник Западного Тянь-Шаня в республике — Падышатинский (158 квадратных километров). Он раскинулся в Джалал-Абадской области на Чаткальском хребте, у границы с Узбекистаном. Заповедник основан в 2006 году и является особо охраняемой зоной.
Более четверти площади заповедника — горные леса, где ценность имеют арчовники (можжевёловые леса). Остальная территория — скалы, луга, водоёмы.
Беш-Аральский заповедник
Беш-Аральский государственный заповедник — крупнейший на западе Киргизии. Его площадь составляет 1,12 тысяч квадратных километров. Он находится в Чаткальском районе Джалал-Абадской области.
Заповедник занимает часть Чаткальского хребта: местность со сложным рельефом. От других упомянутых природоохранных зон он отличается меньшим количеством лесов, а преобладают полупустыни и полусаванны. Здесь произрастают около 1500 видов растений, обитают 150 видов птиц и 46 видов млекопитающих (в том числе снежный барс и тяньшанский медведь).