Свято-Никольский женский монастырь относится к каноническому подразделению Русской православной Церкви, которое охватывает территорию Беларуси. Сооружение включает три придела - правый в честь Благовещения Божией Матери и Святого Крестителя Иоанна, левый в честь Святых Царственных Мучеников. К строительству монастыря приступили в 17 веке после получения согласия польского короля Владислава IV на возведение церкви Святого Николая в Могилеве. В 1637 году первоначально возвели деревянную церковь. Сооружение было построено в тот период, когда епархией в Могилеве правил епископ Сильвестр Коссов.
В 1669 году приступили к возведению Никольского храма из кирпича. Церковь строили в течение 3 лет. По завершении работ храм был освящен епископом Феодосием I. В начале 18 столетия монастырь атаковали шведы. Но на этом трагические события не закончились. После того, как русские войска освободили Могилев, культовое сооружение было подвергнуто нападению калмыцких и татарских полков. Во время пожара монастырский комплекс сильно пострадал. Все эти события привели к тому, что его инокини вынуждены были покинуть здание. Последняя из них выехала из монастыря в 1719 году, найдя приют в Баколабовском монастыре. В тот же период стал действовать мужской монастырь, просуществовавший до 1754 года. Затем до 1930-х годов комплекс использовался как приход.
Недалеко от Никольского собора в 1793 году в годы правления архиепископа Георгия Конисска приступили к строительству зимнего храма. Спустя 5 лет он был освящен архиепископом Анастасием Романенко-Братановским. Ныне он известен как Онуфриевский храм. В годы советской власти не избежала гонений и могилевская епархия. Монастырская и церковная утварь были изъяты, иконостас разрушен. В 1934 году закрыли Свято-Никольский собор. Спустя три года перестала существовать Могилевская епархия, возрожденная лишь в 1989 году, спустя 55 лет. После закрытия свято-Никольского собора, в его помещениях в 1937 году стала действовать пересылочная тюрьма, закрывшаяся в 1941. После Великой Отечественной войны в культовом сооружении размещался книжный склад.
Возрождение могилевской епархии произошло в 1989 году. Его архиереем назначили Максима Кроху - архиепископа Могилевского и Мстиславского. Настоятельницей возрожденного монастыря стала игуменья Евгения Волощук. Весной 1991 года был освящен зимний Онуфриевский храм, принадлежавший Свято-Никольскому монастырю. В тот же год его посетил Святейший Патриарх Алексий II, принесший в дар монастырю литийное паникадило. В 1996 году учредили сестричество во имя святых Веры, Надежды, Любови и матери их Софии. Немного позже был построен корпус для проживания сестер.
Каждый год 6 августа проходит крестный ход от стен монастыря к дому, где жил святитель Георгий Конисский. Теперь в монастыре действует молодежный православный хор и открыта Воскресная школа. У Никольского собора на территории монастыря покоится архиепископ Максим, благодаря которому был возрожден Свято-Никольский женский монастырь, здесь же похоронена первая игуменья восстановленного монастыря Евгения.