Село Арефино лежит на реке Ухра, но его основная часть занимает правый её берег. Мост через водную артерию находится в центральной части населённого пункта. Автотрассой село связано с Рыбинском. В правобережной части села проходит трасса из Арефино в Починок-Болотово, пролегающая через Заднево.
История
Бытует легенда, что село как небольшая деревня возникла в 1721 году. Спустя некоторое время на его территории появилась первая церковь во имя Рождества Христова. Постепенно деревня развивалась и со временем превратилась в обширное поселение на речном берегу с одной стороны и с другой в окружении лесов.
На территории современного Арефино расположены исторические памятники. Ансамбль старинной церкви Рождества Христова датируется 1779 годом. Во второй половине 19 столетия были построены богадельня и церковно-приходская школа. В 1843 годом здесь появился храм во имя Ильи Пророка.
В современном селе работают поликлиника, аптека, средняя школа, почтовое отделение, школа-интернат. В период с 1941 по 1959 годы Арефино обладало статусом административного центра одноимённого района.