Атамуратский этрап Лебапского велаята находится в восточной части страна. На территории региона пересекаются две железнодорожные ветки: Туркменаба – Термез и Карши – Атамурат, а также планируется строительство линии в Афганистан. При этом, город Атамурат является как центром этрапа, так и важнейшим транспортным узлом.
Этрап лежит по обе стороны реки Амударья, вдоль русла которой тянется узкая лента аграрных угодий и населённых пунктов. За пределами «зелёной зоны» – безжизненная пустыня. В нескольких километрах от реки на левом берегу тянется местность Келифский Узбой – бывшее русло Амударьи, ныне превращённое в сеть искусственных озёр-резервуаров. На территории Атамуратского этрапа от главной реки региона ответвляется крупнейший канал Туркменистана – Каракумский, захватывающий часть Келифского Узбоя. Здесь же расположено крупнейшее водохранилище страны – Заидское.
Этрап появился в 1925 году в составе Керкинского округа Советской Туркмении и назывался Керкинским районом. С 1999 года носит современное название.